Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrnp35Q9D384 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms