Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9D2Q3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms