Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hddc3Q9D114 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms