Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms