Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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