Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RpainQ9CWY9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RpainQ9CWY9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
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