Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prkrip1Q9CWV6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkrip1Q9CWV6 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkrip1Q9CWV6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkrip1Q9CWV6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkrip1Q9CWV6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkrip1Q9CWV6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkrip1Q9CWV6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkrip1Q9CWV6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkrip1Q9CWV6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkrip1Q9CWV6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkrip1Q9CWV6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkrip1Q9CWV6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkrip1Q9CWV6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkrip1Q9CWV6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkrip1Q9CWV6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkrip1Q9CWV6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkrip1Q9CWV6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkrip1Q9CWV6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkrip1Q9CWV6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prkrip1Q9CWV6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms