Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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