Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms