Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhobtb3Q9CTN4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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