Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sft2d3Q9CSV6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sft2d3Q9CSV6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sft2d3Q9CSV6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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