Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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