Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Mrpl35Q9CQL6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Mrpl35Q9CQL6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Mrpl35Q9CQL6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Mrpl35Q9CQL6 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Mrpl35Q9CQL6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Mrpl35Q9CQL6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Mrpl35Q9CQL6 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Mrpl35Q9CQL6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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