Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms