Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Use1Q9CQ56 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Use1Q9CQ56 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Use1Q9CQ56 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Use1Q9CQ56 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Use1Q9CQ56 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Use1Q9CQ56 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Use1Q9CQ56 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Use1Q9CQ56 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Use1Q9CQ56 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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