Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ14

Trpd52l3, Tumor protein D52-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpd52l3Q9CQ14 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trpd52l3Q9CQ14 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trpd52l3Q9CQ14 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms