Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms