Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prpf8Q99PV0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms