Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Ubqln4Q99NB8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Ubqln4Q99NB8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
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Ubqln4Q99NB8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Ubqln4Q99NB8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Ubqln4Q99NB8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Ubqln4Q99NB8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Ubqln4Q99NB8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Ubqln4Q99NB8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Ubqln4Q99NB8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubqln4Q99NB8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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