Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a6cQ99N08 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a6cQ99N08 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a6cQ99N08 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a6cQ99N08 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a6cQ99N08 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a6cQ99N08 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a6cQ99N08 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a6cQ99N08 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a6cQ99N08 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a6cQ99N08 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a6cQ99N08 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a6cQ99N08 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms