Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ms4a4dQ99N05 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ms4a4dQ99N05 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ms4a4dQ99N05 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ms4a4dQ99N05 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ms4a4dQ99N05 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ms4a4dQ99N05 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms