Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cstf3Q99LI7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cstf3Q99LI7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cstf3Q99LI7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cstf3Q99LI7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cstf3Q99LI7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cstf3Q99LI7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cstf3Q99LI7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cstf3Q99LI7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cstf3Q99LI7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cstf3Q99LI7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cstf3Q99LI7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cstf3Q99LI7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cstf3Q99LI7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cstf3Q99LI7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cstf3Q99LI7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cstf3Q99LI7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cstf3Q99LI7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cstf3Q99LI7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cstf3Q99LI7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cstf3Q99LI7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cstf3Q99LI7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cstf3Q99LI7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cstf3Q99LI7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cstf3Q99LI7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms