Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms