Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prpf19Q99KP6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prpf19Q99KP6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms