Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ciao1Q99KN2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms