Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc30a1Q99J38 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc30a1Q99J38 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms