Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Smim11aQ99J19 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Smim11aQ99J19 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Smim11aQ99J19 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Smim11aQ99J19 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Smim11aQ99J19 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim11aQ99J19 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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