Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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Cldn16Q925N4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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Cldn16Q925N4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Cldn16Q925N4 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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Cldn16Q925N4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Cldn16Q925N4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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Cldn16Q925N4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Cldn16Q925N4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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