Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
SptssbQ925E8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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