Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb6Q922F4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms