Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hps3Q91VB4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hps3Q91VB4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms