Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8VDP2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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