Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms