Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn4Q8VCH8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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