Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BbxQ8VBW5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BbxQ8VBW5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms