Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ApobrQ8VBT6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms