Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim29Q8R2Q0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms