Protein–RNA interactions for Protein: Q8K387

Usp45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp45Q8K387 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp45Q8K387 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms