Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssh3Q8K330 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms