Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccm2Q8K2Y9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms