Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Depp1Q8K2F3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Depp1Q8K2F3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Depp1Q8K2F3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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