Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brd3Q8K2F0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brd3Q8K2F0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms