Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcf3Q8K268 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms