Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek9Q8K1R7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms