Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Pnma3Q8JZW8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma3Q8JZW8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms