Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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LgsnQ8CIX8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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LgsnQ8CIX8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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LgsnQ8CIX8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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LgsnQ8CIX8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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LgsnQ8CIX8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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LgsnQ8CIX8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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LgsnQ8CIX8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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LgsnQ8CIX8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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LgsnQ8CIX8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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LgsnQ8CIX8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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LgsnQ8CIX8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LgsnQ8CIX8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LgsnQ8CIX8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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