Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Csnka2ipQ8CH19 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Csnka2ipQ8CH19 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms