Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Rdh13Q8CEE7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Rdh13Q8CEE7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Rdh13Q8CEE7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rdh13Q8CEE7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Rdh13Q8CEE7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh13Q8CEE7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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