Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrif1Q8CDD9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Lrif1Q8CDD9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Lrif1Q8CDD9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Lrif1Q8CDD9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Lrif1Q8CDD9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Lrif1Q8CDD9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Lrif1Q8CDD9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrif1Q8CDD9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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