Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Usp44Q8C2S0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Usp44Q8C2S0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Usp44Q8C2S0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Usp44Q8C2S0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Usp44Q8C2S0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Usp44Q8C2S0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Usp44Q8C2S0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Usp44Q8C2S0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp44Q8C2S0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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